MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017812	TATG	2	8	421	428	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017812	ACA	2	6	429	434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017812	A	6	6	479	484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017812	A	7	7	493	499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017812	TAT	2	6	506	511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017812	AAGT	2	8	512	519	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017812	TAGC	2	8	555	562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017812	ATAGC	2	10	563	572	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017812	ATTA	2	8	1713	1720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017812	TAA	2	6	3124	3129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017812	GTTT	2	8	3741	3748	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017812	ATT	2	6	3769	3774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017812	TTA	2	6	3779	3784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017812	TAG	3	9	3839	3847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017812	TGAT	2	8	3864	3871	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017812	T	7	7	3931	3937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017812	T	7	7	3953	3959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017812	TA	3	6	3990	3995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017812	TA	4	8	4000	4007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017812	AAT	2	6	4048	4053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017812	A	6	6	4059	4064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017812	TCAA	2	8	4065	4072	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017812	GA	4	8	4081	4088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017812	TAG	2	6	4392	4397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017812	GAT	2	6	4441	4446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017812	CAA	2	6	4467	4472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017812	TAATT	2	10	4506	4515	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017812	AGT	2	6	4534	4539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017812	N	1218	1218	4563	5780	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017812	ATA	2	6	5786	5791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017812	TTA	2	6	5843	5848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017812	AGAT	2	8	5850	5857	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017812	ATTATG	2	12	5876	5887	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017812	TCG	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017812	TGA	2	6	5966	5971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017812	ATA	2	6	5980	5985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017812	TAA	2	6	5996	6001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017812	AAG	2	6	6039	6044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017812	TAT	2	6	6045	6050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017812	A	6	6	6052	6057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017812	AATAA	2	10	6078	6087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017812	ATG	3	9	6152	6160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017812	AT	3	6	6170	6175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017812	TAA	2	6	6181	6186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017812	TAG	2	6	6232	6237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017812	GAA	3	9	6259	6267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017812	ATA	2	6	6286	6291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017812	CAT	2	6	6292	6297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017812	A	6	6	6299	6304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017812	CTTTT	2	10	6328	6337	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017812	ATT	2	6	6347	6352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017812	GTT	3	9	6389	6397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017812	AGG	2	6	6624	6629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017812	TTA	2	6	7062	7067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017812	ATT	2	6	7074	7079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017812	AT	3	6	7086	7091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017812	T	7	7	7119	7125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017812	T	8	8	7195	7202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017812	TAAAA	2	10	7224	7233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017812	A	6	6	7230	7235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017812	CTT	2	6	7257	7262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017812	GTA	2	6	7274	7279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017812	AT	3	6	7280	7285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017812	ATGTT	2	10	7293	7302	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017812	TA	3	6	7312	7317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017812	AT	3	6	7321	7326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017812	ATC	2	6	7775	7780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017812	ATT	3	9	7781	7789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017812	TTC	2	6	7790	7795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017812	TCA	2	6	7806	7811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017812	N	712	712	7845	8556	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017812	TTTGT	2	10	8566	8575	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017812	AAT	2	6	8576	8581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017812	TA	3	6	8680	8685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017812	TA	4	8	8716	8723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017812	ATTT	2	8	8800	8807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017812	GCA	2	6	8835	8840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017812	AAT	2	6	8844	8849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017812	TAA	2	6	8872	8877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017812	TTCT	2	8	8900	8907	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017812	GA	3	6	8941	8946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017812	TC	3	6	8949	8954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017812	T	8	8	8958	8965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017812	T	8	8	9012	9019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017812	CTTTTA	2	12	9023	9034	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017812	CTTT	2	8	9051	9058	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017812	TTGTA	2	10	9066	9075	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017812	ATT	2	6	9099	9104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017812	A	6	6	9317	9322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017812	AT	4	8	9528	9535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017812	ATT	2	6	9557	9562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017812	GTTGT	2	10	9563	9572	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017812	ATT	2	6	9586	9591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017812	ATTT	2	8	9650	9657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017812	CTTT	2	8	9710	9717	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.